Desde su aparición -la Coordinadora de Tenerife en 1995 y la de Las Palmas tres años después, en 1998-, ambos organismos provinciales han mantenido contacto en todo momento, compartido actividades (encuentros, jornadas, cursos…) y trabajando conjuntamente en temas relativos a la ayuda para el desarrollo. Pero es a partir de 1999 cuando se intensifica esa colaboración, que culmina con la creación, en el 2001, de la Coordinadora de ONGDs de Canarias.

Desde entonces, la federación ha tratado de identificar un espacio propio de encuentro entre las organizaciones de desarrollo que existen en la  Comunidad Autónoma Canaria, profundizando en las claves de la cooperación canaria que permita mejorar la calidad del trabajo de las ONGD y realizando proyectos y campañas de sensibilización con el fin de crear y potenciar una cultura de solidaridad comprometida en Canarias.